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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

境外媒体：马科斯访华开创中菲“黄金时代”******

　　参考消息网1月5日报道据香港《南华早报》网站1月4日报道，菲律宾总统马科斯说，他希望通过上任以来的首次访华之行将与中国的关系提升到“更高层次”。

　　马科斯在启程前说：“在我动身前往北京时，我将为与中国的全面战略合作开启新的篇章……我期待着与习近平主席的会晤，因为我们正努力将两国关系提升到一个更高层次，希望为我们两国人民的和平与发展带来众多的前景和丰富的机会。”

　　中国外交部发言人汪文斌上周表示，中国希望开创中菲友好新的“黄金时代”。

　　另据美国《时代》周刊网站1月3日报道，菲律宾总统马科斯3日在离开马尼拉前往北京时发表讲话称，他期待通过双边协议在贸易、基础设施建设和农业等领域扩大合作。

　　中国是菲律宾主要贸易伙伴之一，在这个东南亚国家的进口中约占20%。

　　马科斯3日说：“我们与北方邻国的友好交往史可追溯至多个世纪前。双边合作稳步发展。如今，我们的关系是深入的、多层面的、互惠互利的。”

　　马科斯此前表示，他将奉行“与所有人为友，不与任何人为敌”的外交政策。

　　又据香港《南华早报》网站1月3日报道，中国和菲律宾都将菲总统马科斯此次访华称为“开创中菲关系新的‘黄金时代’”、巩固不断发展的贸易投资关系以及解决双方共同关切的安全问题的契机。

　　菲律宾和平、暴力和恐怖主义研究所所长罗梅尔·班劳伊敦促马科斯总统将对华关系提升至全面战略伙伴层次。

　　班劳伊对记者说，全面战略伙伴关系将使马尼拉受益，因为它能确保与北京和华盛顿都建立更密切关系而无需选边站。

　　他说：“我们将是伙伴，而非对手。”

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）